Ежелгі заманда Қырым Ресейге қосылғанда қазіргі Одесса епархиясы Екатеринослав және Херсон-Таврид деп аталды. 1837 жылы бұл үлкен аумақ екі аймаққа бөлінді, олардың біреуі Одесса қаласын қамтыды. Епархия Херсон-Одесса деп аталды.
1991 жылы Херсон тәуелсіз епархияға айналғанда Одесса және Измаил епархиясы құрылды. Тарихи тұлғалардың бірі - Митрополит Габриэль, ол Одессаның іргетасын алғашқылардың бірі болып қасиетті етіп, үш тасты алып, қаладағы үш шіркеудің іргетасына қалаған. Оның күшімен Оңтүстік Пальмирада монастырь құрылды, ол Владика қайтыс болғаннан кейін ашылды.
Аңызға айналған архиепископтар
1838 жылы басқа архипастордың көмегімен қалада семинария ашылды. Бүкіл Новороссийск өлкесінде ол осындай мекемелер арасында көшбасшыға айналды. Одесса епархиясы шіркеулер мен ғибадатханалар ғана емес, бай. Өлке тарихынан мұндай тұлға орыс хризостомы атанған Әулие Иннокентий (Борисов) сияқты ерекшеленеді. Әулие Иннокентий Одесса үшін ең қиын кезеңде қызмет етуге мәжбүр болдыуақыт. 1853-1857 жылдардағы Қырым соғысы болды. Қала екі рет толық жойылу қаупінде болды, бірақ Иннокентий әке ұйымдастырған Құдай Анасының Касперский иконасы алдындағы жалпы дұға қала мен оның тұрғындарын сөзсіз өлімнен құтқарды.
Осыдан жүз жыл бұрын, 1917 жылы Ресейге, Украинаға және басқа жерлерге жау шіркеулерге, діни қызметкерлер мен монастырларға шабуыл жасаған қиын күндер келді. Бұл тағдырды және Одесса епархиясын өтпеді. 1919 жылы теологиялық семинария жабылды, Одесса және Херсон митрополиті өз отанынан кетуге мәжбүр болды. Православие епархиясын реновацияшыл-шизматтар басып алды.
Портта Әулие Николайдың құрметіне бағышталған шағын шіркеу ғана Патриарх Тихонға адал болып қалды. Онда керемет шопан, имандылық пен тақуалық шырағы Иона Атаманский қызмет етті. Оның арқасында Одессада православие сақталды. Жөндеушілер 1944 жылға дейін шыдады және қала басқыншылардан азат етілгенде ғана Одесса епархиясы Иемізге шынайы қызмет ете бастады.
Православиені қудалау
Кеңес құдайсыздығы жылдарында Одесса епархиясы Мәскеу Патриархының қонағы болған жер болды. Содан кейін архиепископ Никон сол жерде қызмет етті, ол қаладағы шіркеулердің көпшілігін қалпына келтіріп, жөндеп, монастырьді қайта жандандырды. Одесса Патриархтың жазғы резиденциясы болғандықтан, Орыс Православие Шіркеуінің жетекшілері үнемі осында жиналды. Кеңес өкіметі Одесса епархиясына адал болуға мәжбүр болды. Хрущевтің қудалау жылдарында оған қиын болды, тіпті Одессада шіркеулер мен монастырьлар жабылды. Сонда митрополитӘке Борис (Вик) болды, ол ғажайып түрде Киелі жатақхана соборы мен теологиялық семинарияны сақтап қалды.
Бүгінгі епархия
Алайда православиеге шабуылдар тоқтамады және КСРО-ның ыдырауымен митрополит Филарет шіркеулерге қарсы шиматикалық қозғалысты бастады. Ол Украинаның діни қызметкерлеріне қысым көрсетіп, олардың кейбірін алауыздыққа түсіре алды. Митрополит Агафангельдің Одессаға келуімен шіркеу өмірі жақсарып, жандана бастады. Бүгінде Одесса епархиясының шіркеулері қаланың безендірілуі және рухани орталығы болып табылады.